Дебютировав в сборной в 17 лет, Роке Санта Крус заставил о себе говорить, забив три мяча на Кубке Америки-1999. Примечательно, что Роке обрел профессиональный статус уже в пятнадцатилетнем возрасте, внимание селкционеров мюнхенской «Баварии» привлек уже в 17-летнем возрасте, когда выступал за молодежную сборную. Сразу после Кубка Америки-1999 подписал контракт с «Баварией». А сумма трансфера составила 5 миллионов евро.

Уже в первом сезоне он начал отрабатывать потраченные деньги, забив пять мячей в 11 играх. В сезоне 2001/02 Санта-Крус отличился пять раз в 21 матче, но затем из-за травмы Роке был вынужден пропустить начало сезона 2002/03. Едва оправившись от одной травмы он получил другую - связок колена, из-за чего снова должен был долго лечиться. А в мае произошел рецидив старой травмы, и Санта-Крус лег на операционный стол, завершив сезон и пропустив финал Кубка Германии. В том сезоне нападающий записал на свой счет пять голов.

В прошлом сезоне Роке снова поджидали разочарования. Главное из них - смерть брата. После была операция на колене, и лишь в самом конце чемпионата он снова смог появиться в составе.

Не обошли травмы Санта-Круса и в нынешнем сезоне. До недавнего времени не было известно, сумеет ли он принять участие в чемпионате мира. В октябре у него был разрыв крестообразных связок колена, и лишь в конце марта игрок приступил к полноценным тренировкам.

Санта-Крус защищал честь сборной Парагвая на первенстве мира в Японии и Корее. Забив один гол в четырех встречах, Санта-Крус и его партнеры отправились домой после поражения от сборной Германии в 1/8 финала. К началу отборочной кампании ЧМ-2006 Санта-Крус вновь вернулся в сборную, за которую не выступал некоторое время из-за травмы и причин личного характера.

Роке обладает взрывной скоростью, принимает мгновенные решения и обладает отменными ударами с обеих ног. В детстве любимым игроком Санта Круса был форвард сборной Нидерландов Марко ван Бастен.

Роке Санта-Крус уже шесть лет в составе "Баварии", однако накануне сезона 2006/2007 гг. тренер Феликс Магат держит 24-летнего игрока за новичка. В свой первый год "Баварии" тренер мог рассчитывать на игрока парагвайской сборной очень недолгое время: из-за травмы Санта-Крус пропустил практически весь сезон. "Я не могу в полной мере оценить его игровые достоинства", - говорит Магат. К сожалению, после успешного выступления за клуб в сентябре-октябре 2005 г. Санта-Крус получил новый удар. Из-за разрыва крестообразных Роке вновь выбыл до конца апреля следующего года.